消毒是利用物理、化学或生物学方法杀灭或清除外界环境中的病原微生物，从而阻断病原的传播途径，即防止疫病的发生。不同的消毒方法其消毒效果有所差异，因此猪场在消毒时应根据不同的对象和目的选择相应的消毒方法，并明确消毒重点和把控消毒频次。
1.按消毒对象选择消毒方法
化学消毒法是猪场最常用的消毒方法，也是消毒工作的主体内容。物理消毒法和生物消毒法相对更简捷易行，如在猪场进出口设置紫外线消毒室和对粪便进行堆积发酵消毒，对提高猪场的总体消毒效果能起到很好的作用。同时应按预消毒物品的特性选择不同的消毒方法。比如，不怕热、不怕湿的物品可应用煮沸高温消毒；怕热、怕湿的物品可应用气体消毒剂消毒；怕热而不怕湿的物品可应用消毒液浸泡消毒，以确保呈现最佳的消毒效果。
2.按疫病类型明确消毒重点
消毒的作用环节是在病原传播给猪群所经过的途径，因此针对每种病原微生物的消毒重点也就有所不同。经消化道传播的传染病，如仔猪副伤寒、猪瘟、猪病毒性腹泻等，应搞好饲养环境卫生与控制相对湿度，并注意加强饲料、饮水和饲养工具的及时有效消毒。经呼吸道传播的传染病，如猪喘气病、猪肺炎霉形体病、猪胸膜肺炎、猪流行性感冒等，就要求有重点地对猪舍空气和可接触的物体表面加强严格消毒。
3.按疫病流行把控消毒频次
现场消毒不能如实验室无菌操作的那样可以将病原微生物全部杀灭，因此应根据实际情况或疫病感染压力把控消毒频次。猪场消毒工作必须要定时进行，并推广不会对猪呼吸道、鼻及泪腺等黏膜上皮造成较大刺激的带猪消毒方法，重视生产各环节有效消毒，加强疫病多发季节的消毒工作，就不难达到杀灭或减少病原的目的。比如，产仔舍新生仔猪免疫功能不完善，容易得病，搞好猪舍消毒工作尤其重要，一般要求每周消毒1-2次。
