随着气温的日渐降低，“秋季是水产品生长、养殖生产管理的重要季节。白露到霜降期间，气候凉爽、天气晴朗。秋分之后冷空气频繁南下，降温降水致表层水温剧降，易引起上下层水体提前对流，底部缺氧、有毒物质激增。藻类种群容易消亡，在剧变天气里容易倒藻、转水。雾天增加，气压低，易致水体缺氧。
首先要加强池塘水质调控。一要及时换水，少量多次，要吸取中上层水，以增加浮游生物种类，防止和减少蓝绿藻的滋生形成“蓝淀水”。养殖池塘应每隔15天左右泼洒一次生石灰，增加池水钙质，用量每米水深10公斤/亩。二是施用芽孢杆菌、光合细菌、硝化细菌等微生物制剂调控水质，以降低亚硝酸盐、氨氮、硫化氢、pH值过高等因素对水体造成的危害，使养殖水体始终保持“肥、活、嫩、爽”状态。三是配备增氧机的塘口，养殖户在这一时期要根据天气、养殖动物的活动等情况适时合理地开启增氧机，促进表层水和底层水的循环，使水体溶氧均匀合理，增加鱼类食欲和抗病能力。
秋季温度仍然较高，养鱼户要注意细菌性出血病的发生。雨天过后，寄生虫容易大量繁殖，水质往往会变差，更容易诱发出血病。气温下行时，鲫鱼要预防病毒性出血病即“鳃出血”的重新爆发。投料时拌饲免疫增强剂如黄芪类产品，提高鱼体自身抵抗力。
鱼塘入秋便要采用内服加外用的方法驱杀寄生虫，注意减少使用强刺激性杀虫药物对鱼体及水质的影响。重要的是做好预防工作，一旦发病，及早治疗
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